Fase de elongación
El factor σ se libera y el core del enzima continua la síntesis por su cuenta. Se forma en esta fase loq ue se conoce como burbuja de transcripción, que abarca unos 17 nucleótidos. El Rna permanece unido al Dna unos 12 nucleótidos. Las zonas ricas en A y T se sintetizan de manera más rápida, mientras que las ricas en G y C serán más lentas, siendo conocidas como zonas de pausa. La velocidad de elongación puede ser de entre 30 y 6 nucleótidos por segundo, pero en las zonas de pausa puede llegar a 0,1 nucleótido por segundo. En la etapa de elongación, la RNA polimerasa cubre unos 60 pb. Cuando el RNA tiene unos 15 nucleótidos, el enzima se compacta y pasa a cubrir solo 35 pb. El enzima va avanzando a trompicones, ya que la elongación avanza, pero el frente del enzima no avanza paulatinamente, sino que lo hará de golpe. La elongación implica por lo tanto un proceso de contracción y elongación del enzima.
