RNA polimerasas nucleares
Existen tres RNA polimerasas: I, II y III. La polimerasa I no es sensible a la α amanitina, mientras que la II sí lo es y en el caso de la polimerasa III dependerá de la especie. La polimerasa I está en el nucleolo y la II y la III en el nucleoplasma. La polimerasa I transcribe los genes de tipo I, que son los ribosómicos, con excepción de uno. Los genes transcritos por la II son los genes de tipo II, que comprenden los que traducidos darán lugar a las proteínas, y los RNA pequeños. Los genes de tipo III, transcritos por la polimerasa III son los RNAt. Son enzimas grandes, con muchas subunidades, de más de 500 KDa de peso. Constan de 2 subunidades grandes, 2 medianas y muchas pequeñas. Las polimerasas bacterianas son (α2ββ’)σ. β y β’ de euc<ariotas son homologas entre ellas y con las bacterianas. Son las unidades encargadas de componer el centro catalítico del enzima. Las 2 α son también homólogas con las bacterianas. Mantienen la unión del enzima. Las unidades pequeñas son más variables. En la polimerasa II encontramos unas 10 subunidades. La grande, similar a β’, tienen un dominio C terminal, el CTD, que consta de secuencias de 7 aminoácidos repetidas una serie de veces, dependiendo del organismo. Se puede repetir desde 17 hasta 50 veces, en mamíferos. Parece ser que si eliminamos la mitad de las repeticiones de estas secuencias, la polimerasa deja de funcionar. Es posible que se una al DNA, pero sobre todo se cree que interacciona con otros factores de transcripcióm y su función se podrá modificar por fosforilación. Los enzimas nucleares son muy diferentes a los de mitocondrias o cloroplastos, pero estos últimos suelen estar codificados por genes nucleares. En cloroplastos encontramos enzimas grandes, similares a los de las bacterias, codificados pese a todo en el núcleo en su mayor parte y alguno en el propio cloroplasto. La polimerasa de las mitocondrias es más pequeña, con una sola subunidad. Pesa unos 70 KDa y tiene solo una subunidad.
