Inducción
Para volver al ciclo vírico harán falta Xis e Int. Entre Int y Sib está la zona d erecombinación entre el fago y la bacteria, para la zona attB. Sib quedará por lo tanto al lado contrario de Xis e Int, por lo que el RNA no se degradará como se ha descrito antes. En el caso de este fago λ, se produce una modificación de la polimerasa por acción de las proteínas antiterminadoras, para poder pasar a transcribir otros genes. En el caso del fago Sp01, de B.subtilis, se produce una modificación de la polimerasa a nivel de la incorporación de una nueva σ, que reconocerá otros genes. Este es el caso también del fago T4. En el caso de los fagos T3 y T7, se produce una nueva RNA polimerasa, producto de los genes tempranos, de manera que se reconocerán los promotores del DNA, de los siguientes bloques de genes.
Integración del DNA y escisión
Para la integración del DNA, el virus necesitará la proteína Int. Para la escisión harán falta la proteína Int y la Xis. Existen 2 mecanismos de control. Por un lado a nivel de la presencia o no de CII y por otro a nivel de degradación de DNA. Si hay CII, el virus entrará en lsiogenia, para lo cual deberá haber niveles alto de Int y bajos de Xis. CII se une al DNA a nivel del promotor de Int, activando la transcripción de este gen. El promotor de int está en xis.
Lisis o lisogenia
A continuación veremos un resumen de la entrada en lisis o lisogenia, en función de los factores que se unan al DNA. - Cro se une al promotor de CI y ésta no se puede sintetizar: lisis. - CII y CIII presentes y activos: lisogenia. - CII y CIII: Si cII no es activa o no está acompañada de CIII, lisis. Si son activos se realizará la síntesis de CI a partir del promotor de establecimiento. - Si la bacteria vive en un medio rico, la bacteria tendrá proteasas activas y fuertes, con lo que se degradadará CII y se entrará en lisis, lo que beneficiará al virus. Si el medio es pobre, entrará en fase de lisogenia. - Si la bacteria es mutante en los genes de las proteasas, no inactivarán CII y habrá una alta frecuencia de lisogenia.
