Eucariotas superiores
Todas las células de un organismo tienen todos los genes, por lo que ha de haber una regulación en la expresión de estos genes. Dentro de esta regulación distinguimos entre regiones reguladoras y factores de transcripción. Regiones reguladoras Promotores Elementos o secuencias de control, situados en 5’, normalmente “Enhancers”, que puede estar en 5’ o 3’, o incluso, lejos del gen Factores de transcripción Factores generales o basales Factores constitutivos Factores específicos Regiones reguladoras Para que haya una correcta expresión del gen, debe haber regiones que controlen esta expresión, que son las secuencias de control o reguladoras. Continue reading ‘Eucariotas superiores’
Genes de clase III
Son reconocidos por la polimerasa III. Sus productos son muy heterogéneos, como tRNAs, rRNA 5s, smRNA como U6, o AluRNA. Podemos diferenciarlos según su procesamiento. Todos los RNA con excepción de los tRNAs no tienen procesamiento. El gen del rRNA 5s se sintetiza a partir de genes repetidos. Todos tienen estructuras muy conservadas. tRNAs Constituye el 15% del RNA total de las células eucariotas. Constan de entre 70 y 80 nucleótidos, pero deberán pasar por un procesamiento, donde podrán perder algunos nucleótidos de los extremos y donde se le añadirá en el extremo 3’ el CCA, donde se unirá el AA. Un elevado porcentaje de bases de estos RNAs son bases modificadas. En muchos casos existe un intrón central en el RNA. Promotores de los genes de clase III Existen 2 tipos de promotores en estos genes, los promotores internos y los promotores no internos. Encontramos promotores internos en los tRNA y en el rRNA 5s. Los promotores no internos se dan en el resto de los genes de esta clase. Se descubrieron cuando se observó que se podía eliminar toda la parte anterior a +1 en un gen, sin que la transcripción de este se viese afectada. Los genes que tienen promotores no internos tienen promotores similares a los de la clase II, tienen incluso caja TATA. Hacen falta los TFIIIA, TFIIIB, y TFIIIC para transcribir el 5s, mientras que solo C para los de transferencia. De nuevo, TFIIIB está formado por TBP y otros factores. En el caso del rRNA 5s se une en primer lugar TFIIA, después TFIIIC y finalmente TFIIIB, al que se unirá la polimerasa. Parece ser que al unirse la polimerasa e iniciarse la transcripción, se desprenderán los factores, con excepción de TFIIIB. La proteína TFIIIA es una proteína con dominio de unión al DNA por dedos de Zn. En el caso de la transcripción de los tRNA no es necesario el factor TFIIIA, sino que solo TFIIIC y TFIIIB podrán transcribir ya. Parece ser que la polimerasa se detendrá al llegar a una determinada región, rica en TA, entre zonas de GC.
Transcripción en eucariotas
El DNA está a partir de ahora distribuido en diversos cromosomas. No habrá operones, por lo que no habrá RNA policistrónico, excepto en el caso de los RNA ribosómicos. Entre los diferentes genes encontraremos fragmentos de DNA no codificador. El DNA codificador solo es el 3% del total. En genomas más complejos encontraremos más genes y diferentes combinaciones de genes. Por otro lado, en eucariotas podemos encontrar ya genes con intrones. En Saccharomyces solo hay algunos genes con intrones, mientras que en Drosophila, hay alguno genes todavía no tienen intrones. En humanos se cree que solo los genes de las histonas no tienen intrones. Además, la membrana nuclear separa la transcripción y la traducción en el espacio y el tiempo. Podemos encontrar 3 RNA polimerasas nucleares, a las que hay que añadir las que podemos encontrar en cloroplastos y mitocondrias.
