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Estructura de la IGS

Estructura de la IGS

Se trata de una estructura que depende de la especie, pero cuya estructura es bastante general. Dentro de la IGS está el promotor, main promoter, con la estructura ya descrita. Secuencias similares a esta pueden estar repartidas por todo la IGS, siendo los promotores de la IGS. Se van sintetizando gracias a esto pequeñas cadenas de RNA que se irán acumulando, permitiendo así una mejor síntesis del rRNA cuando llegue el momento. El RNA finaliza antes de entrar en el IGS, porque justo en la entrada hay unas secuencias terminadoras, ocho. Se trata de un bloque de 17 / 18 pb, repetidos 8 veces. Estas repeticiones pueden ser reconocidas por algún factor que permitirá el fin de la transcripción. Este es el ejemplo descrito, pero puede estar sujeto a variaciones según la especie. La función d elos promotores de las IGS no acaba de estar clara. En Xenopus no existen las secuencias de terminación, sino que hay una región que permite la liberación de la polimerasa, aunque parece ser que es posible que solo se libere el RNA. Antes del promotor principal habría una terminación.

Promotores de los genes de clase I

Promotores de los genes de clase I

Serán promotores reconocidos por la RNA polimerasa I. Se trata de secuencias consenso muy caracterizadas en humanos. Existen 2 regiones involucradas en el proceso de transcripción: • core promoter. Va de –45 a –20. Es una secuencia rica en G y C. • Elemento de control upstream (UCE), situado hacua 5’ Si solo está el core promoter, se podrá realizar la síntesis, pero si está presente el UCE, la síntesis será mejor. La composición de bases del UCE es similar a la del core promoter. Para poder funcionar, la polimerasa requerirá una serie de factores: • UBF1: se une a la región del core y a UBF1, que también se une al UCE. Normalmente actúa como un dímero • SL1: Este factor está formado a partir de 4 monómeros. Requiere a UBF1 para funcionar. Una de las unidades que lo componen es TBP. TBP interviene junto con las otras polimerasas en los procesos de transcripción. La polimerasa contacta con SL1 a través de TBP. Actúa como un posicionador de la polimerasa, permitiendo el correcto posicionamiento de esta antes de iniciar la transcripción.