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Lisogenia

Lisogenia

Asociada al gen cI. En el operador es donde actúa la proteína reguladora. Tenemos 2 operadores enabalgados sobre el promotor, que son OL y OR. De manera, que si está unida la proteína reguladora, la polimerasa no podrá acceder a los promotores PL y PR, por lo que acabará el ciclo lítico. CI es el represor que se unirá a los operadores. En OL no permite la transcripción de los genes N y de los siguientes, a partir del promotor PL. Por el OR no se permite la transcripción de cro, a la vez que se estimula la síntesis de cI, de manera que para sintetizar cI necesitaremos cI. Mientras haya cI se sintetizará más cI, lo que explica que la lisogenia sea estable. Lo es hasta que por alguna razón se degrada cI o ésta deja de ser funcional. Esta misma región es la responsable de la inmunidad que presenta la bacteria frente a otras infecciones, ya que el represor actuará sobre todos los operadores, los del fago original y sobre los de la nueva infección.

Se han aislado diferentes tipos de mutantes: - cI-: No pueden sintetizar el represor. Siempre entrarán en la vía lítica. - λ vir: mutación en la región operadora. La proteína CI no podrá unirse, por lo que entrará en la vía lítica. Si uno de los primeros mutantes infecta un fago lisogénico no habrá lisis, pero si la nueva infección se produce por el segundo mutante se producirá la lisis. Para iniciar la síntesis de CI hay una vía alternativa. Si se sintetizan CII y CIII, que son proteínas retardadas, que actúan como reguladoras positivas, provocando la síntesis de CI. CII es un activador necesario para la síntesis de CI. Pero CII es muy inestable y fácilmente degradable por los mecanismos de degradación de la bacteria. Actuará CIII para estabilizarla. Por lo tanto, se sintetizará CI a partir de la unión de CII y CIII al promotor de establecimiento, PRE. Este promotor promueve la entrada en la fase de lisogenia. El promotor provocará la transcripción de un mensajero que pasará por cro hasta cI, pero lo que se transcribirá de cro será antisentido, por lo que no dará ninguna proteína, mientras que los de CI si será correcto. Este transcrito antisentido de cro se podrá unir al transcrito sentido de cro, inactivándolo, ya que cro está relacionado con la lísis. La otra mitad del transcrito sintetizará CI, que se unirá a los operadores e iniciará la entrada en lisogenia, que se mantendrá estable gracias a la autorregulación.

Esporulación en B.subilis

Esporulación en B.subilis

Puede existir en 2 fases morfológicamente diferenciadas. Puede ser una célula vegetativa normal en un medio rico, o se una célula vegetativa en un medio pobre. En un medio rico, se dividirá por multiplicación, pero en un medio pobre se dará una división asimétrica. El resultado de esta división será de dos células. Una célula dará lugar a la espora, mientras que la otra célula lisará. Este proceso está regulado transcripcionalmente. El proceso dura unas 8 horas e implica grandes cambios en las características y capacidades de la bacteria. Algunos genes de la etapa vegetativa dejan de expresarse y se expresan otros que antes no se expresaban. La esporulación va asociada a cambios en la subunidad σ. Dependiendo de la subunidad σ que esté asociada en un momento dado, se reconocerán unos u otros promotores. Normalmente se denominaba a las unidades σ por el peso molecular, pero actualmente se emplean letras. LA σ característica de las bacterias y la mayoritaria es la σ55 o σA. Esta forma se encuentra en un 90% de los casos. El cambio de la subunidad σ provocará que se reconozcan otros promotores. En ambos compartimentos sucede lo mismo, al cambiar la subunidad σ se inicia la transcripción de diferentes genes, entre los que habrá otra unidad σ. Esta unidad σ sustituirá a la que está unida a la polimerasa, iniciando la transcripción de otros genes. Este proceso se irá dando hasta que se forme la espora y la célula madre lise.

espora-celula-madre.JPG

Resulta básico para el funcionamiento del proceso el hecho de que E y F han de activarse solo en la parte que les toca, por lo que deberán estar inhibidos allí donde no se les necesita. Actualmente se sabe que: F puede formar un complejo con SpoIIAB, de manera que si se libera de esa proteína, resultará activado. SpoIIAB está controlado por SpoIIAA. Si SpoIIAA no está fosforialdo, se puede unir a SpoIIAB, con lo que esta proteína no se podrá unir a σF, que será activa. Si AA está fosforilado, σF será activo. El encargado de fosforilar SpoIIAB es SpoIIE, sólo en la espora. El proceso de activación de σE es más complejo, y se da por rotura proteolítica, mediante la proteasa SpoIIGA, que está situada en el tabique de separación de espora y célula. Esta proteína resulta activada por SpoIIR, que se transcribe por acción de la polimerasa unida a σF. El proceso de activación de σK es muy similar al de la σE, pero con IVF y IVB en lugar de GA y R. Este proceso está muy claro en los esquemas. La activación de SpoOA se da por fosforilación, respondiendo a señales externas, debido a ciertas condiciones ambientales, en un proceso mediado por quinasas. La activación de SpoOA activa la cascada de factores σ que se ha descrito anteriormente. Se ha de tener en cuenta que existe comunicación entre ambos compartimentos de la célula, tanto espora como célula madre. Existen otros organismos procariotas que pueden tener diferentes unidades σ, como por ejemplo E.coli. El cambio de unidades σ se como respuesta al cambio de determinadas condiciones ambientales, activando así los genes necesarios para responder a esa condición. E.coli tiene como principal σ la 70, pero también podemos encontrar otras como la 32 o la 54. Los genes que las codifican son respectivamente rpoD, rpoH y rpoN. Se sustituye la 70 por la 32 en condiciones de shock térmico, permitiendo así la transcripción de 17 genes. Uno de los primeros genes en transcribirse, aún por la 70 es el rpoH, que permitirá la posterior transcripción del resto de genes. La unidad 54 se activa cuando en el medio no hay N suficiente, permitiendo así el aprovechamiento de fuentes alternativas de N.

Respuesta SOS en E.Coli

Respuesta SOS en E.Coli

Se trata de un conjunto de mecanismos que se observan cuando se somete a las células a daños considerables en su DNA, a causa de rayos UV, por ejemplo. Se trata de una capacidad incrementada de reparación del DNA. Los responsables de esta capacidad son los genes SOS, de los que se conocen entre 15 y 20. Todos estos genes están regulados de manera coordinada por la proteína represora LexA, del gen lexA. Se conce este mecanismo como regulón. Existe un gen, el recA, que codifica para la proteína RacA, que es la inductora de la respuesta del regulón. El gen lexA es capaz de autorregularse, y de regular a recA. La proteína RecA se activa al sufrir daños, provocando la degradación del represor. En una situación normal,LexA está reprimida, por lo que no habrá transcripción de los genes SOS, y sólo habrá transcripción basal de lexA y de recA. En una situación donde se producen daños, RecA se activará, degradando la proteína LexA, por lo que se iniciará la transcripción de los genes SOS, con lo que también habrá una mayor transcripción de los genes recA y lexA. La transcripción de los genes SOS estimula los mecanismos de reparación de la célula, como por ejemplo los genes uvrA, uvrB,… La síntesis de recA inhibe la acción incrementada de recA. Cuando cesa la situación de emergencia, se puede volver a reprimir los genes SOS, debido a la síntesis existente de lexA.

Activación de RecA
No se conoce el mecanismo exacto in vivo, pero se cree que en condiciones in vitro la proteína es capaz de reconocer cadenas de DNA sencillas, de una sola cadena. Esto sólo se ha podido comprobar in vitro. Los promotores de los genes SOS han de tener alguna secuencia conservada, de manera que puedan ser reconocidos por LexA. Se ha comprobado que todos tienen lo que se conoce como la caja SOS. Se trata de una secuencia consenso. La caja SOS consta de 20 nucleótidos, de los cuales 7 son siempre iguales. La posición de la caja SOS va variando. El gen uvrB está regulado sólo en parte por el sistema SOS, ya que tiene 2 promotores y solo un sistema SOS. Parece ser que siempre habrá un mínimo de transcripción de uvrB, por lo que habrá un sistema de reparación rápido.